Selected publications in the field of stained-glass research:

• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Tomasz Szybisty, Farbverglasungen des 19. und frühen 20. Jahrhunderts in Krakauer Wohnhäusern, in: Le vitrail dans la demeure des origines à nos jours. Vitrer et orner la fenêtre (actes du XXVIII^e colloque international du Corpus Vitrearum, Troyes, 4-8 juillet 2016), ed. Karine Boulanger, Gand 2018, p. 216–231.
• Korpus witraży z lat 1800–1945 w kościołach rzymskokatolickich metropolii krakowskiej i przemyskiej, red. Wojciech Bałus, Tomasz Szybisty, t. II: Tomasz Szybisty in collaboration with Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Archidiecezja krakowska. Dekanaty pozakrakowskie, Kraków 2015.
• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Witraże we wnętrzach mieszkalnych i użyteczności publicznej (na przykładzie wybranych realizacji Krakowskiego Zakładu Witrażów z lat 1902–1939), in: Dziedzictwo na nowo odkrywane. Detal architektoniczny 1850–1939, ed. Jadwiga Roguska, Warszawa 2014, p. 245–277.
• Korpus witraży z lat 1800–1945 w kościołach rzymskokatolickich metropolii krakowskiej i przemyskiej, red. Wojciech Bałus, Tomasz Szybisty, vol. 1: Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Tomasz Szybisty, in collaboration with Paweł Karaszkiewicz and Anna Zeńczak, Archidiecezja krakowska. Dekanaty krakowskie, Kraków 2014.
• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Maria Magdalena Łubieńska (1833–1920) – artystka wyemancypowanaa / Maria Magdalena Łubieńska (1833–1920) – an emancipated female artist, „Sacrum et decorum" 6, 2013, p. 9–32.
• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Działalność Franciszka Białkowskiego i Władysława Skibińskiego. Przyczynek do badań nad dziejami warszawskich pracowni witrażowniczych / The activity of Franciszek Białkowski and Władysław Skibiński. A contribution to the research on the work of Warsaw stained-glass studios, „Sacrum et Decorum" 5, 2012, p. 63–86.
• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, „Do wielce szanownych naszych P. T. Klientów..." – urywek z dziejów Krakowskiego Zakładu Witrażów, w: Witraże secesyjne. Tendencje i motywy, ed. Tomasz Szybisty, Kraków–Legnica 2011, p. 77–85.
• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Zapoznana pasja architekta Franciszka Mączyńskiego / The Forgotten Passion of Franciszek Mączyński, an Architect, „Sacrum et Decorum" 3, 2010, p. 143–164.
• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska,  „Dzielna niewiasta". Iza z Madeyskich Żeleńska (1878–1956), w: „Żeby wiedzieć". Studia dedykowane Helenie Małkiewiczównie, ed. Wojciech Walanus, Marek Walczak, Joanna Wolańska, Kraków 2008, p. 337–351.
• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Zapomniani twórcy. Stan badań nad polskim witrażownictwem (druga połowa wieku XIX – rok 1945) / Forgotten Artists. Status of Research on Polish Stained Glass (from the second half of the 19^th century until 1945), „Sacrum et Decorum" 1, 2008, p. 94–123.
• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Witraże w Krakowie. Dzieła i twórcy, Kraków 2005 (= „Krakowska Teka Konserwatorska" 5).
• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Dzieje witraży Stanisława Wyspiańskiego w kościele oo. franciszkanów w Krakowie, „Rocznik Krakowski" 70, 2004, p. 61–88.
• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Teodor Andrzej Zajdzikowski (1840–1907) pionier krakowskich witrażowników, „Rocznik Krakowski" 69, 2003, p. 151–170.
• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Krakowski Zakład witrażów, oszkleń artystycznych i mozaiki szklanej S. G. Żeleński. Uwagi na marginesie prac nad monografią, in: Dziedzictwo polskiej sztuki witrażowej, ed. Krystyna Pawłowska, Joanna Budyn-Kamykowska, Kraków 2000, p. 150–161.
• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Świeckie witraże w Krakowie. Uwagi o działalności krakowskich zakładów witrażowniczych od końca XIX wieku do roku 1939, „Rocznik Krakowski" 53, 1987, p. 139–148.
• Danuta Czapczyńska-Kleszczyńska, Uwagi o działalności krakowskich firm witrażowniczych w okresie od końca XIX wieku do 1939 r. [Na marginesie prac nad katalogiem witraży w kamienicach i budowlach użyteczności publicznej w Krakowie], „Biuletyn Historii Sztuki" 47, 1985, nr 2, p. 211–216.